La Direction Générale des Douanes comprend les Directions Techniques Nationales ci-après :
- La Direction des Ressources Humaines et de la Formation;
- La Direction d’Audit et de Contrôle Interne;
- La Direction de la Règlementation et de la Coopération Douanière;
- La Direction de la Facilitation, du Partenariat, des Régimes Economiques et Particuliers;
- La Direction des Ressources Financières et de la Logistique;
- La Direction des Enquêtes douanières, du Renseignement et de l’Analyse des Risques;
- La Direction de la Comptabilité et des Etudes;
- La Direction des Systèmes d’Information.
